نبعت فكرة مصفاة الذهب بعد ان من الله تعالى على السودان بثروة كبيرة من الذهب الخام والذي كان يصدر الى الخارج في شكل سبائك من الذهب الخام الذي يحتوي على كميات من الفضة وغيرها من المعادن المصاحبة.
وبفضل الله وبحب الخيرين من ابناء هذا البلد جاءت فكرة انشاء المصفاة لتقوم بتصفية خام الذهب والاستفادة من العناصر المصاحبة له كالفضة والنحاس، وذلك في بداية عام 2011 وتم الشروع في العمل منذ منتصف العام ليكتمل انشاء المصفاة في الاسبوع الاول من ابريل لعام 2012 حيث تم افتتاحها رسميا في يوم الاربعاء الموافق 3 ذو القعدة 1433هـ الموافق 19 سبتمبر 2012م.